Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC112Q8NEF3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms