Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG16L2Q8NAA4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms