Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms