Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GDPD1Q8N9F7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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GDPD1Q8N9F7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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GDPD1Q8N9F7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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GDPD1Q8N9F7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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GDPD1Q8N9F7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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GDPD1Q8N9F7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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GDPD1Q8N9F7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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GDPD1Q8N9F7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDPD1Q8N9F7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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