Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYDE1Q6ZW31 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms