Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD2Q6P5Q4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms