Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL6Q6ICC9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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