Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC102BQ68D86 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms