Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CEP170Q5SW79 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms