Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDRD12Q587J7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms