Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SFT2D3Q587I9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms