Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TTLL9Q3SXZ7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms