Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
KRTAP20-1Q3LI63 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms