Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NDUFA9Q16795 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms