Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
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ECM1Q16610 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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ECM1Q16610 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ECM1Q16610 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
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