Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC18A3Q16572 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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