Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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LY6EQ16553 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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LY6EQ16553 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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LY6EQ16553 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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LY6EQ16553 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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LY6EQ16553 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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LY6EQ16553 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LY6EQ16553 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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