Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
TNXAQ16473 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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TNXAQ16473 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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TNXAQ16473 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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TNXAQ16473 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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TNXAQ16473 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNXAQ16473 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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