Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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GABRA6Q16445 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRA6Q16445 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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