Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
LAMA4Q16363 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
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