Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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