Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SF1Q15637 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SF1Q15637 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SF1Q15637 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SF1Q15637 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SF1Q15637 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SF1Q15637 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SF1Q15637 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SF1Q15637 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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