Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRADDQ15628 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRADDQ15628 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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