Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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TAF1AQ15573 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF1AQ15573 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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