Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF4Q15306 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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