Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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PTPRRQ15256 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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PTPRRQ15256 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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PTPRRQ15256 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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PTPRRQ15256 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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PTPRRQ15256 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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PTPRRQ15256 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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PTPRRQ15256 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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PTPRRQ15256 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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