Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HERPUD1Q15011 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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