Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCLAFQ15004 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCLAFQ15004 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
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