Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSC3Q14574 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSC3Q14574 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms