Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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GBX1Q14549 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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GBX1Q14549 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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GBX1Q14549 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GBX1Q14549 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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