Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms