Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA4Q13439 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms