Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN3Q13286 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLN3Q13286 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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