Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GRIN2BQ13224 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
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