Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP4Q13115 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP4Q13115 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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