Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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TRAF3Q13114 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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TRAF3Q13114 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF3Q13114 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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