Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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TRDNQ13061 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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TRDNQ13061 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRDNQ13061 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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