Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
STRN3Q13033 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
STRN3Q13033 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms