Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC10A2Q12908 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms