Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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NFIAQ12857 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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NFIAQ12857 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NFIAQ12857 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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NFIAQ12857 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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NFIAQ12857 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NFIAQ12857 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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