Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSME1Q06323 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms