Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EXOSC9Q06265 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXOSC9Q06265 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms