Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DEUP1Q05D60 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms