Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHRNB3Q05901 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms