Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC6A3Q01959 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC6A3Q01959 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms