Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BNC1Q01954 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms