Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM3Q01628 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms