Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms