Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK16Q00536 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms