Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VLDLRP98155 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms